細(xì)菌幾乎無(wú)處不在，可你有沒(méi)有想過(guò)，空間站中主要有哪些細(xì)菌？近日，美國(guó)國(guó)家 空*（NASA）下屬的噴氣推進(jìn)實(shí)驗(yàn)室（JPL）開(kāi)展了一項(xiàng)研究，發(fā)現(xiàn)空間站中的細(xì)菌大多與皮膚相關(guān)，如放線菌。他們?cè)凇禡icrobiome》上發(fā)表了這一成果。
噴氣推進(jìn)實(shí)驗(yàn)室的Kasthuri Venkateswaran及其同事收集了空間站（ISS）以及JPL兩個(gè)凈室的灰塵樣本，這兩個(gè)凈室主要用于航天器部件的組裝。通過(guò)細(xì)菌培養(yǎng)和定量PCR分析，研究小組估計(jì)了微生物群體，并利用測(cè)序鑒定出兩個(gè)環(huán)境下的微生物組。
定量PCR分析表明，空間站的樣本有著zui高的細(xì)菌密度。不過(guò)在經(jīng)過(guò)PMA處理后，這種差異就不再明顯。ISS HEPA樣本中的活細(xì)菌比例是1.7%，ISS真空樣本中的活細(xì)菌為2.7%，凈室JPL-103中的活細(xì)菌為4.5%。然而，另一個(gè)凈室JPL-SAF中活細(xì)菌的比例高達(dá)66.8%。
通過(guò)細(xì)菌培養(yǎng)，研究人員鑒定出41個(gè)細(xì)菌菌株，其中大多數(shù)屬于厚壁菌，少數(shù)屬于變形菌。他們指出，桿菌在兩個(gè)ISS樣本中占優(yōu)勢(shì)，不過(guò)葡萄球菌只存在于真空樣本中。他們補(bǔ)充道，凈室樣本中缺乏或很少有這兩個(gè)屬。
通過(guò)羅氏-454的焦磷酸測(cè)序，Venkateswaran及其同事產(chǎn)生了大約10萬(wàn)條細(xì)菌序列，讀長(zhǎng)超過(guò)500 bp。在利用PMA去除死細(xì)胞后，ISS真空樣本有著zui高的序列數(shù)量，超過(guò)3萬(wàn)條，而HEPA過(guò)濾器樣本的數(shù)量zui低。研究人員指出，HEPA過(guò)濾器的幾乎所有序列都屬于棒狀桿菌，這也存在于真空樣本中。
Illumina MiSeq系統(tǒng)上的測(cè)序又產(chǎn)生了680萬(wàn)條序列。通過(guò)這些序列，研究人員發(fā)現(xiàn)，ISS樣本以放線菌、桿菌和梭菌為主，而凈室樣本則含有高水平的α-變形菌和γ-變形菌。研究人員認(rèn)為，空間站和凈室樣本之間的差異是明顯的。
利用焦磷酸測(cè)序，Venkateswaran及其同事還發(fā)現(xiàn)了35,000條真菌序列，其中大部分屬于座囊菌綱、散囊菌綱和銀耳綱。他們指出，真菌的豐富度與位置有很大關(guān)系，在凈室中大多為座囊菌和散囊菌，而ISS樣本中含有更多散囊菌和酵母菌等。
總的來(lái)說(shuō)，Venkateswaran及其同事報(bào)告稱，空間站和凈室中的微生物群落存在明顯的差異?？臻g站的樣本以放線菌為主，這可能是因?yàn)橛詈絾T在那里生活。而凈室中的放線菌數(shù)量則通過(guò)更衣過(guò)程來(lái)降低。
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