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上海科興利用新技術(shù)構(gòu)造新型蛋白質(zhì)相互作用圖譜
點擊次數(shù)：622 發(fā)布時間：2011-9-15
據(jù)報道，近期來自上?？婆d商貿(mào)有限公司在蛋白質(zhì)相互作用研究中取得突破性進展。這一研究成果，上海佳倫生物科技有限公司做出相關(guān)的解析，為人們解答這一困惑和不解，從而十分給力。
生命系統(tǒng)復雜性zui重要的特征不僅在于其組成成分的復雜性，更在于各組成成分之間的關(guān)系，而在所有的這些關(guān)系中，蛋白質(zhì)之間的相互作用在形成幾乎所有生命系統(tǒng)、調(diào)控各種生理/病理進程中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。蛋白質(zhì)相互作用不僅為研究未知蛋-白質(zhì)的生物學功能提供了線索，也為充分了解一個細胞或一個生物途徑的生物學機制，提供了必要的信息。
近年來科學家們發(fā)展了許多高通量的實驗方法，并以此發(fā)現(xiàn)、建立了越來越多的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡。但是，現(xiàn)有的蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡只能反映蛋白質(zhì)之間存在連接關(guān)系，而真實生命體系中大部分的蛋白質(zhì)相互作用具有信號轉(zhuǎn)導、轉(zhuǎn)錄激活/抑制等明顯的信號流方向性。
為了證明這一切，弄清所有的迷惑，因此上海佳倫生物科技有限公司的相關(guān)工作人員利用功能基因組及蛋白質(zhì)組技術(shù)結(jié)合生物信息學方法成功構(gòu)建了一個新型的定向蛋白質(zhì)相互作用圖譜，這對于解析細胞內(nèi)蛋白質(zhì)間相互關(guān)系以及相關(guān)信號傳導機制具有極其重要的意義。
在這篇文章中，研究人員首先分析獲得了來自京都基因與基因組百科全書（Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes ，KEGG）的473個人類全長開放閱讀框（ORFs），然后利用酵母雙雜交技術(shù)對這些ORF進行了檢測，從而構(gòu)建了一個基于Y2H的PPI蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡圖譜，其中包含了2626種相互作用，涉及到1126個人類蛋白。為了獲得更廣泛準確的分析數(shù)據(jù)，研究人員利用來自公共資源的PPI數(shù)據(jù)進一步對Y2H PPI蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡進行了擴展。基于樸素貝葉斯分類算法（naïve Bayesian classifier.）研究人員將來自10組實驗數(shù)據(jù)的蛋白質(zhì)相互作用與Y2H PPI圖譜數(shù)據(jù)進行綜合分析后成功構(gòu)建出了*個定向人類蛋白質(zhì)相互作用 （HPPI2）網(wǎng)絡圖譜，其中涵蓋了6339個蛋白，32,706種相互作用。
這些研究數(shù)據(jù)為科學家們提供了蛋白互作的雙重數(shù)據(jù)，這些數(shù)據(jù)，以及將來的蛋白互作組圖譜將組成一個信息庫。
上?？婆d是一家技術(shù)服務型渠道企業(yè),在行業(yè)發(fā)展中所承擔的角色是一種溝通產(chǎn)出方和需求方（科研和市場）的媒介，我們致力為行業(yè)人才提供了包括科研在內(nèi)的更多出口，為科研提供了有力的硬件支持，有效地促進科研和市場需求結(jié)合，提高了科研成果的轉(zhuǎn)化效率，使得科研更具活力。目前國家對于生物行業(yè)的發(fā)展給予了極大的重視，但更多地側(cè)重于科研的投入，行業(yè)內(nèi)缺乏*的技術(shù)服務體系和渠道支撐...
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