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專訪邱小波:突破桎梏 取得創(chuàng)新性成就

時(shí)間:2013-6-13閱讀:455
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    “無限風(fēng)光在險(xiǎn)峰”,科學(xué)研究的道路從來都不是平坦的,唯有那些敢于破除固有桎梏,進(jìn)行創(chuàng)新性研究的人才能走出自己的一條道路來,近期北京師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,中國(guó)醫(yī)學(xué)*,中科院微生物研究所等單位的研究人員在《細(xì)胞》(Cell)上發(fā)表了一項(xiàng)突破性成果:介導(dǎo)組蛋白通過特異的蛋白酶體降解的是乙酰化,而不是普遍認(rèn)為的泛素化修飾方式,這突破了原有理論的桎梏,為這一領(lǐng)域的研究開辟了一條新航道。領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是北京師范大學(xué)邱小波教授,邱教授一直從事蛋白質(zhì)降解和細(xì)胞凋亡的研究,曾揭示了泛素連接酶Nrdp1介導(dǎo)的細(xì)胞凋亡抑制蛋白BRUCE的降解是引發(fā)細(xì)胞凋亡的新途徑,發(fā)現(xiàn)了具有促進(jìn)去泛素化酶活性的蛋白酶體亞單位hRpn13等。為了更深入的了解這項(xiàng)重要的成果,生物通特了邱小波教授,就讀者感興趣的問題請(qǐng)教了他。
據(jù)介紹,人類的遺傳信息儲(chǔ)存于DNA。雖然人體所有體細(xì)胞DNA都一樣,其編碼基因的表達(dá)在不同細(xì)胞中卻不盡相同。那么,基因在不同類型的細(xì)胞中怎樣選擇性表達(dá)呢?人類DNA長(zhǎng)達(dá)1.8米,通常纏繞在組蛋白上形成核小體,核小體經(jīng)進(jìn)一步折疊將DNA包裝在小小的細(xì)胞核中。組蛋白起著DNA守護(hù)者的作用,決定著DNA上哪些基因可以表達(dá)。組蛋白自身有多種修飾,可能組成在細(xì)胞分裂時(shí)可遺傳至下一代的密碼,即“組蛋白密碼”,用以指導(dǎo)基因表達(dá)的表觀遺傳調(diào)控。
zui近科學(xué)家發(fā)現(xiàn),已分化的人類體細(xì)胞經(jīng)過重編程變成具有可發(fā)育成個(gè)體潛力的細(xì)胞,該過程改變的就是表觀遺傳調(diào)控。細(xì)胞內(nèi)的各種分子常常處于不斷合成與降解的更新中,但為了保持遺傳信息的穩(wěn)定性,其DNA并不會(huì)降解。在體細(xì)胞中,作為DNA的守護(hù)者及表觀遺傳信息載體的組蛋白也一直被認(rèn)為不會(huì)降解。
然而,邱小波團(tuán)隊(duì)通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),在精子發(fā)生和體細(xì)胞DNA損傷修復(fù)過程中,組蛋白均會(huì)降解,這修正了科學(xué)界關(guān)于體細(xì)胞組蛋白不降解的論點(diǎn)。在精子發(fā)生過程中,單倍體基因組中約96%的組蛋白zui終都會(huì)丟失,只有4%的組蛋白將其所載表觀遺傳信息傳給了下一代。精子中組蛋白的選擇性降解可能有利于清除可導(dǎo)致疾病的表觀遺傳標(biāo)記,并避免清除從父代獲得的、有益的表觀遺傳印記。在病原菌感染、核輻射或某些致癌物影響下,細(xì)胞內(nèi)DNA常會(huì)發(fā)生損傷。如不及時(shí)修復(fù)DNA損傷,細(xì)胞可能會(huì)發(fā)生癌變,甚至危及存活。為了有效地修復(fù)損傷的DNA, 組蛋白必需從核小體中釋放出來,從而為DNA修復(fù)蛋白順利到達(dá)工作位點(diǎn)提供足夠的空間保障。所以,此時(shí)的組蛋白降解可確保損傷的DNA被及時(shí)修復(fù),以維持細(xì)胞的遺傳信息穩(wěn)定。
這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)乙?;皇欠核鼗?,介導(dǎo)了組蛋白通過特異的蛋白酶體降解。泛素化和乙酰化分別為兩種不同的蛋白翻譯后修飾,在基因表達(dá)的表觀遺傳調(diào)控中都起著重要的調(diào)控作用。如泛素化一樣,乙?;粌H修飾組蛋白,還可以修飾眾多其它蛋白。目前已在七千多種人類蛋白中發(fā)現(xiàn)兩萬(wàn)多個(gè)乙酰化位點(diǎn)。因此,這一發(fā)現(xiàn)將可能開辟關(guān)于乙?;閷?dǎo)蛋白質(zhì)降解研究的一個(gè)嶄新領(lǐng)域。并且該研究還揭示組蛋白去乙?;敢种苿┐龠M(jìn)DNA雙鏈斷裂誘導(dǎo)的、由乙?;閷?dǎo)的組蛋白降解,增強(qiáng)細(xì)胞對(duì)DNA損傷的敏感性,促進(jìn)細(xì)胞死亡。這一發(fā)現(xiàn)為它們的臨床應(yīng)用提供了重要基礎(chǔ)。生物通:組蛋白被認(rèn)為是一種不易被機(jī)體降解的高度穩(wěn)定蛋白,但這一點(diǎn)也令不少科學(xué)家感到疑惑,因?yàn)槿绻M蛋白不像其他蛋白那樣被降解,那為什么細(xì)胞中沒有積累大量的組蛋白,貴研究組的這項(xiàng)重要發(fā)現(xiàn)從一個(gè)方面破解了這個(gè)謎題,令我們十分好奇的是,您的這項(xiàng)研究是從哪方面入手,揭示出了核心組蛋白的降解過程,不是通過泛素化(非經(jīng)典泛素化),而是乙?;哪兀壳窠淌冢弘m然體細(xì)胞的組蛋白通常非常穩(wěn)定,很難證明其降解,但在精子發(fā)生過程中組蛋白大量丟失,有理由認(rèn)為此時(shí)它們是可降解的。所以,有些學(xué)者試圖揭秘精子發(fā)生過程中組蛋白降解機(jī)制。由于通常蛋白質(zhì)都是通過泛素介導(dǎo)的蛋白酶體通路降解,所以他們主要在尋找催化組蛋白多聚泛素化并促進(jìn)其降解的泛素連接酶,但一直沒有成功。這時(shí),我們?cè)谙耄遣皇墙M蛋白降解根本就不是泛素化介導(dǎo)的?
由于有理由相信,組蛋白仍然是由蛋白酶體降解的。我們就在想是否有特異的、不依賴于泛素化的蛋白酶體呢?由于精子發(fā)生過程中組蛋白大量丟失,我們就想到了從睪丸中提取這類蛋白酶體。幸運(yùn)的是,睪丸中果然有特異的蛋白酶體。然而,它們不能有效降解泛素化蛋白,也不能有效降解未修飾的組蛋白。這表明,如果這些特異蛋白酶體能在體內(nèi)降解組蛋白,這些組蛋白 可能需要特定的其它修飾。但這是什么修飾呢?因?yàn)橐阴;鶊F(tuán)可中和組蛋白中的正電荷,從而使組蛋白更易從DNA中脫離出來,我們這時(shí)就想到了乙?;S腥さ氖?,睪丸中特異蛋白酶體通過特殊的激活因子PA200確實(shí)能識(shí)別乙?;慕M蛋白并促進(jìn)它們的降解。由于體細(xì)胞中也PA200, 我們也就有了研究體細(xì)胞中乙?;閷?dǎo)的組蛋白降解的線索。zui終實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,體細(xì)胞中的組蛋白在DNA損傷修復(fù)時(shí),也能通過乙?;閷?dǎo)的蛋白酶體通路降解。生物通:數(shù)十年的研究已證實(shí)了組蛋白和其翻譯后修飾在基因調(diào)控,以及將這些改變傳遞到下一代細(xì)胞中的重要性。精子作為受精卵組成的一部分,其重要性不言而喻,您的這項(xiàng)研究在精子發(fā)生過程中得到了驗(yàn)證,并指出其中只有少量的組蛋白相關(guān)表觀遺傳信息傳遞給了下一代,那么這個(gè)選擇過程是如何進(jìn)行的呢?細(xì)胞如何知道哪些信息需要降解,哪些不需要呢?邱教授:我們并不是*個(gè)發(fā)現(xiàn)精子中只有少量組蛋白可傳給下一代,該現(xiàn)象在上世紀(jì)70年代就有人發(fā)現(xiàn)了,我們只是發(fā)現(xiàn)它們通過蛋白酶體降解的機(jī)理。至于如何選擇,非常復(fù)雜。我們?nèi)栽谘芯恐小?br />生物通:組蛋白乙?;腿ヒ阴;c基因調(diào)控關(guān)系密切,這項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)的這種由PA200介導(dǎo)的乙?;到膺^程,與常見的乙酰化修飾過程存在差異嗎?
邱教授:乙?;揎椷^程可能沒有太多的特殊性,可能只是PA200識(shí)別乙?;臋C(jī)制與其它的乙酰化結(jié)合蛋白不一樣。
生物通:我們知道,組蛋白的乙?;c其他的泛素化,甲基化修飾等之間也存在關(guān)聯(lián),那么這種乙?;到膺^程,是否也涉及或者影響到了其他的修飾方式呢?
邱教授:我們有數(shù)據(jù)顯示乙酰化介導(dǎo)的組蛋白降解仍可能需要其它修飾的輔助作用。
生物通:此前同樣是發(fā)表在Cell雜志上一篇文章中,中科院的劉江博士等人發(fā)現(xiàn)精子的表觀遺傳修飾影響了早期胚胎發(fā)育,您認(rèn)為在精子發(fā)生過程中出現(xiàn)的組蛋白降解,是否也會(huì)影響到胚胎發(fā)育呢?
邱教授:劉江博士的研究也非常重要,精子DNA甲基化的強(qiáng)勢(shì)作用可能正好彌補(bǔ)了精子中組蛋白稀缺的不足。但剩余的精子組蛋白,盡管很少,應(yīng)仍在胚胎發(fā)育中起著重要的作用。同時(shí),卵子中仍有大量的組蛋白,是不是在胚胎發(fā)育中起到補(bǔ)充作用呢? 來源:生物通

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