醫(yī)療機(jī)構(gòu)高通量基因測序?qū)嶒?yàn)室設(shè)計(jì)布局建設(shè)
高通量測序檢測實(shí)驗(yàn)室也叫NGS實(shí)驗(yàn)室，是以高通量測序技術(shù)為檢測手段，來完成臨床疾病篩查、診斷或輔助診斷、腫瘤基因突變檢測等項(xiàng)目。
由于NGS技術(shù)對所檢測的核酸模板進(jìn)行大量擴(kuò)增，容易出現(xiàn)實(shí)驗(yàn)室污染導(dǎo)致檢測結(jié)果不準(zhǔn)確；且NGS實(shí)驗(yàn)要求高、影響因素多，實(shí)驗(yàn)過程處理不當(dāng)也會(huì)導(dǎo)致檢測結(jié)果異常。因此一個(gè)嚴(yán)格有序、規(guī)范的NGS實(shí)驗(yàn)室是非常必要的。
醫(yī)療機(jī)構(gòu)高通量基因測序?qū)嶒?yàn)室設(shè)計(jì)布局建設(shè)
高通量測序?qū)嶒?yàn)室設(shè)計(jì)要求
按照《臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室工作規(guī)范》的要求，原則上臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室應(yīng)當(dāng)設(shè)置以下區(qū)域：試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)、標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)。這4個(gè)區(qū)域在物理空間上必須是相互獨(dú)立的，各區(qū)域無論是在空間上還是在使用中，應(yīng)當(dāng)始終處于分隔狀態(tài)，不能有空氣的直接相通。根據(jù)使用儀器的功能，區(qū)域可適當(dāng)合并。例如使用實(shí)時(shí)熒光PCR儀，擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)可合并；采用樣本處理、核酸提取及擴(kuò)增檢測為一體的自動(dòng)化分析儀，則標(biāo)本制備區(qū)、擴(kuò)增區(qū)、擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)可合并。
臨床基因擴(kuò)增檢驗(yàn)實(shí)驗(yàn)室的空氣流向可按照試劑儲存和準(zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)進(jìn)行，防止擴(kuò)增產(chǎn)物順空氣氣流進(jìn)入擴(kuò)增前的區(qū)域?？砂凑諒脑噭﹥Υ婧蜏?zhǔn)備區(qū)→標(biāo)本制備區(qū)→擴(kuò)增區(qū)→擴(kuò)增產(chǎn)物分析區(qū)方向空氣壓力遞減的方式進(jìn)行?？赏ㄟ^安裝排風(fēng)扇、負(fù)壓排風(fēng)裝置或其他可行的方式實(shí)現(xiàn)。如果條件允許，建議將NextSeq CN500測序儀所在的測序室工作溫度控制在18-22℃，濕度控制在65%以下。
高通量測序?qū)嶒?yàn)室的強(qiáng)電、弱電需求
建議每個(gè)房間預(yù)留1網(wǎng)絡(luò)端口、1電話端口。并為高通量測序?qū)嶒?yàn)室配備獨(dú)享8M以上的網(wǎng)絡(luò)。
試劑準(zhǔn)備間：冰箱、冰柜等；總功率≤5kw
樣本制備間：高速離心機(jī)、低速離心機(jī)、垂直混勻儀等；總功率≤10kw
擴(kuò)增間：PCR儀、熒光定量PCR儀等；總功率≤5kw
測序間：UPS電源（測序儀、服務(wù)器都與UPS電源連接）；UPS接入功率6KW
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