清析技術研究院可提供分子動力學模擬測試相關的測試檢測服務,可出具備CMA/CNAS資質(zhì)的檢測報告,是專業(yè)的第三方檢測機構(gòu)。詳情可聯(lián)系我們進行咨詢,關于分子動力學模擬測試的部分內(nèi)容介紹如下:
分子動力學模擬測試周期是多久?
到樣后7-10個工作日可出具檢測報告(可加急),根據(jù)樣品及其檢測項目/方法會有所變動,具體需咨詢工程師。
分子動力學模擬是基于牛頓力學原理模擬原子和分子的物理運動軌跡和狀態(tài)的方法。對于較為復雜的生物分子體系,通常通過對相互作用粒子的牛頓運動方程進行數(shù)值解析來確定體系內(nèi)粒子的軌跡,而粒子間的作用力和勢能采用分子力學力場來確定。
分子動力學模擬的主要步驟
1、確定起始構(gòu)型
一個能量較低、結(jié)構(gòu)合理的起始三維構(gòu)型是進行MD模擬的步。生物大分子的起始構(gòu)型主要來自實驗數(shù)據(jù),如X射線晶體衍射法或核磁共振波譜法測定的分子結(jié)構(gòu),或根據(jù)已知分子結(jié)構(gòu)通過同源建模得到的結(jié)構(gòu)等。
2、選用適當力場和模擬軟件
選擇適當?shù)牧鍪沁M行MD模擬的基礎。不同的力場具有不同的適用范圍和局限性,需要根據(jù)所研究的體系和問題適當選取。同時使用多種力場時,應當注意所用力場間的兼用性。
3、構(gòu)建體系和能量最小化
已經(jīng)有了研究對象分子的起始構(gòu)型,接著要根據(jù)研究對象所處的環(huán)境(如氣相、水溶液或跨膜環(huán)境等)構(gòu)建模擬體系,在生物大分子周圍加上足夠的溶劑分子。體系的大小和模擬元胞的形狀依具體體系而定,需要兼顧合理性和可行性。
4、平衡過程
體系構(gòu)建好之后要賦予各個原子初始速度,這一速度是根據(jù)一定溫度下的玻爾茲曼分布隨機生成的,然后對各個原子的運動速度進行調(diào)整,使得體系總體在各個方向上的動能之和為零,即保證體系沒有平動位移。
5、數(shù)據(jù)采集過程
體系達到平衡之后則可以進行長時間的模擬,從這個過程中采集樣本進行分析。采樣要在系統(tǒng)平衡后進行,可記三條軌跡,即體系中粒子的坐標、速度和能量隨時間的變化。
6、MD結(jié)果分析
結(jié)果分析主要是通過系綜平均得到可與實驗結(jié)果相比較的宏觀物理量。數(shù)據(jù)分析可用的工具有多種,常用MD軟件包內(nèi)包含一些結(jié)果分析程序,也可以根據(jù)需要自編一些結(jié)果分析軟件。
分子動力學模擬測試流程是怎樣?
1、聯(lián)系/咨詢工程師,詳細溝通了解檢測需求;
2、工程師根據(jù)檢測項目及檢測需求進行報價;
3、雙方確定簽訂合同及保密協(xié)議;
4、寄樣/取樣,開始檢測;
5、完成檢測,出具檢測報告,進行后期服務;
清析研究院服務范圍和優(yōu)勢有哪些?
1、為公司企業(yè)、高等院校、科研單位、事業(yè)單位、醫(yī)院、律師事務所以及個人客戶等提供專業(yè)技術服務。
2、具備專業(yè)的CMA/CNAS資質(zhì)認證,檢測資質(zhì)齊全,為客戶提供專業(yè)的咨詢與服務。
3、實驗室儀器設備種類齊全,保證測試數(shù)據(jù)準確可靠;
4、擁有強大的檢測專家團隊,全國各地多家分支機構(gòu);
5、在線一對一服務流程,根據(jù)客戶需求制定特色檢測方案和解決辦法;
如有相關檢測需求歡迎通過在線咨詢,微信咨詢,熱線,預約檢測留言等方式進行咨詢,實驗室工程師將會一對一為您詳細解答。