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一、假陰性(無(wú)擴(kuò)增產(chǎn)物)
現(xiàn)象:正對(duì)照有條帶,樣品無(wú)條帶
可能原因:
· 模板:含有 Taq 酶抑制劑、雜蛋白,模板上樣量低或模板降解
· 引物:引物降解,引物設(shè)計(jì)不合理
· 試劑:酶失活,buffer 不合適
· 反應(yīng)條件:退火溫度高,延伸時(shí)間短
解決方法:
· 純化模板并重新提取,并檢測(cè)模板是否含有抑制劑
· 重新設(shè)計(jì)引物并低溫保存
· 優(yōu)化 buffer,摸索鎂離子濃度或適當(dāng)加入 DMSO(小于 0.3%)
· 提高退火溫度,增加延伸時(shí)間(反應(yīng)條件參照試劑盒說(shuō)明書(shū))
二、假陽(yáng)性
現(xiàn)象:空白對(duì)照出現(xiàn)條帶
可能原因:
· 引物設(shè)計(jì)不適,與目的序列具有同源性
· 試劑污染:水、移液槍等被核酸污染
· 樣品間出現(xiàn)交叉污染
解決方法:
· 實(shí)驗(yàn)儀器高壓滅菌
· 實(shí)驗(yàn)試劑(酶除外)高壓滅菌,離心管槍頭一次性使用
· 規(guī)范實(shí)驗(yàn)操作
· 假陽(yáng)性可通過(guò)巢式 PCR 解決,或者使用特異性較高的試劑盒擴(kuò)增
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